国家开发银行新疆分行成立于1999年12月，历经艰苦创业、快速成长、跨越发展、新的征程四大阶段，始终围绕中央治疆方略，聚焦新疆社会稳定和长治久安总目标，主动承担金融戍边使命。截至2021年8月末，累计向新疆提供社会融资总量11388亿元，表内本外币贷款余额3429亿元，连续第15年保持同业第一，是新疆第一家表内贷款余额超过3000亿元的银行业金融机构，表内人民币贷款余额3008亿元，进一步体现了开发性金融的责任担当和主动作为，成为金融援疆的“排头兵”和“主力军”。

2013年6月和2015年8月，系统内二级分支机构——伊犁分行、喀什分行相继开业，标志着开行金融援疆和支持新疆向西开放的工作进入加速发展的快车道。新疆分行荣获了“全国文明单位”、“全国五一劳动奖状”、“全国青年文明号”、“开发建设新疆奖章”等多项全国及省部级荣誉，累计168人次员工获省部级以上荣誉。